Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnn2Q08093 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnn2Q08093 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnn2Q08093 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms