Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrepQ07475 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrepQ07475 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrepQ07475 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrepQ07475 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms