Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx4Q07424 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms