Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CluQ06890 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CluQ06890 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CluQ06890 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CluQ06890 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CluQ06890 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CluQ06890 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CluQ06890 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CluQ06890 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CluQ06890 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CluQ06890 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CluQ06890 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CluQ06890 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CluQ06890 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CluQ06890 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CluQ06890 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CluQ06890 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CluQ06890 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CluQ06890 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CluQ06890 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CluQ06890 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CluQ06890 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CluQ06890 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CluQ06890 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CluQ06890 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CluQ06890 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CluQ06890 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CluQ06890 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms