Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnal1Q05A62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnal1Q05A62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms