Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a1Q05722 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a1Q05722 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a1Q05722 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms