Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Emx1Q04742 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx1Q04742 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx1Q04742 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Emx1Q04742 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms