Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcad1Q04692 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcad1Q04692 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms