Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelaQ04207 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelaQ04207 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RelaQ04207 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RelaQ04207 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelaQ04207 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RelaQ04207 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms