Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk7Q03147 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms