Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1sQ02789 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cacna1sQ02789 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cacna1sQ02789 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacna1sQ02789 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms