Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nhlh1Q02576 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhlh1Q02576 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhlh1Q02576 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms