Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ly9Q01965 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms