Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RykQ01887 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RykQ01887 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RykQ01887 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RykQ01887 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RykQ01887 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RykQ01887 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RykQ01887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RykQ01887 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RykQ01887 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RykQ01887 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RykQ01887 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RykQ01887 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RykQ01887 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RykQ01887 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RykQ01887 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RykQ01887 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RykQ01887 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RykQ01887 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RykQ01887 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RykQ01887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RykQ01887 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RykQ01887 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RykQ01887 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RykQ01887 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RykQ01887 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms