Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VcpQ01853 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VcpQ01853 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VcpQ01853 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VcpQ01853 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms