Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde1bQ01065 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde1bQ01065 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms