Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpina1cQ00896 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Serpina1cQ00896 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpina1cQ00896 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms