Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scn1bP97952 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scn1bP97952 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scn1bP97952 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms