Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AlkP97793 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AlkP97793 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AlkP97793 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
AlkP97793 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AlkP97793 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AlkP97793 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AlkP97793 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AlkP97793 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AlkP97793 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AlkP97793 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
AlkP97793 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AlkP97793 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AlkP97793 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AlkP97793 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AlkP97793 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AlkP97793 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AlkP97793 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AlkP97793 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AlkP97793 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
AlkP97793 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AlkP97793 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AlkP97793 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AlkP97793 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AlkP97793 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AlkP97793 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AlkP97793 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AlkP97793 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AlkP97793 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AlkP97793 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AlkP97793 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AlkP97793 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AlkP97793 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AlkP97793 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AlkP97793 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AlkP97793 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AlkP97793 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AlkP97793 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AlkP97793 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AlkP97793 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AlkP97793 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AlkP97793 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AlkP97793 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AlkP97793 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AlkP97793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AlkP97793 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AlkP97793 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AlkP97793 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
AlkP97793 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
AlkP97793 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AlkP97793 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AlkP97793 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
AlkP97793 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AlkP97793 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AlkP97793 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AlkP97793 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
AlkP97793 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AlkP97793 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AlkP97793 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AlkP97793 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AlkP97793 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AlkP97793 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AlkP97793 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AlkP97793 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
AlkP97793 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
AlkP97793 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AlkP97793 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AlkP97793 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
AlkP97793 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AlkP97793 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AlkP97793 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AlkP97793 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AlkP97793 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AlkP97793 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AlkP97793 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AlkP97793 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AlkP97793 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AlkP97793 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AlkP97793 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
AlkP97793 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
AlkP97793 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
AlkP97793 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
AlkP97793 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AlkP97793 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AlkP97793 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AlkP97793 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AlkP97793 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
AlkP97793 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
AlkP97793 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AlkP97793 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.2 ms