Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TgfbiP82198 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TgfbiP82198 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms