Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1bP70700 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1bP70700 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms