Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf3P70671 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf3P70671 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf3P70671 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf3P70671 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf3P70671 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf3P70671 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf3P70671 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf3P70671 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf3P70671 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf3P70671 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf3P70671 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms