Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Cux2P70298 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cux2P70298 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Cux2P70298 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cux2P70298 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cux2P70298 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cux2P70298 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cux2P70298 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cux2P70298 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cux2P70298 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cux2P70298 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cux2P70298 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cux2P70298 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cux2P70298 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Cux2P70298 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Cux2P70298 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cux2P70298 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cux2P70298 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms