Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkn1P70268 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms