Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crnkl1P63154 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crnkl1P63154 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crnkl1P63154 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crnkl1P63154 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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