Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps27aP62983 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms