Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacng7P62956 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacng7P62956 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacng7P62956 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacng7P62956 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacng7P62956 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms