Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3cP62823 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3cP62823 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3cP62823 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms