Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd3P62320 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd3P62320 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms