Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ActbP60710 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ActbP60710 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ActbP60710 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ActbP60710 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ActbP60710 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ActbP60710 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ActbP60710 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ActbP60710 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ActbP60710 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ActbP60710 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ActbP60710 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ActbP60710 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ActbP60710 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ActbP60710 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ActbP60710 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ActbP60710 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ActbP60710 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ActbP60710 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ActbP60710 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ActbP60710 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ActbP60710 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ActbP60710 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ActbP60710 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ActbP60710 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ActbP60710 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ActbP60710 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ActbP60710 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ActbP60710 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ActbP60710 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ActbP60710 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ActbP60710 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ActbP60710 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ActbP60710 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ActbP60710 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ActbP60710 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms