Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps5P59438 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps5P59438 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps5P59438 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps5P59438 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps5P59438 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps5P59438 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps5P59438 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps5P59438 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms