Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf2P59222 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf2P59222 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms