Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm2P58774 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm2P58774 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm2P58774 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms