Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm1P58771 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm1P58771 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm1P58771 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms