Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctdsp1P58466 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms