Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Strn4P58404 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strn4P58404 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strn4P58404 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strn4P58404 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Strn4P58404 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strn4P58404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strn4P58404 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strn4P58404 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms