Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcstnP57716 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NcstnP57716 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcstnP57716 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcstnP57716 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcstnP57716 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcstnP57716 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms