Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmoP56726 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmoP56726 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmoP56726 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SmoP56726 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SmoP56726 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmoP56726 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmoP56726 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SmoP56726 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SmoP56726 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmoP56726 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmoP56726 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmoP56726 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmoP56726 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmoP56726 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmoP56726 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmoP56726 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmoP56726 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmoP56726 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmoP56726 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmoP56726 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SmoP56726 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmoP56726 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmoP56726 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmoP56726 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmoP56726 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmoP56726 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmoP56726 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmoP56726 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmoP56726 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmoP56726 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmoP56726 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmoP56726 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmoP56726 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmoP56726 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmoP56726 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmoP56726 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms