Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp2c40P56657 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cyp2c40P56657 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp2c40P56657 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp2c40P56657 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp2c40P56657 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms