Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GalcP54818 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GalcP54818 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GalcP54818 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GalcP54818 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GalcP54818 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GalcP54818 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GalcP54818 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GalcP54818 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GalcP54818 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GalcP54818 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GalcP54818 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GalcP54818 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GalcP54818 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GalcP54818 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GalcP54818 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GalcP54818 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GalcP54818 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GalcP54818 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GalcP54818 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GalcP54818 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GalcP54818 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GalcP54818 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GalcP54818 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GalcP54818 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GalcP54818 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GalcP54818 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GalcP54818 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GalcP54818 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GalcP54818 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GalcP54818 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GalcP54818 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GalcP54818 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GalcP54818 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GalcP54818 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GalcP54818 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GalcP54818 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GalcP54818 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GalcP54818 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GalcP54818 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GalcP54818 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GalcP54818 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GalcP54818 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GalcP54818 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GalcP54818 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GalcP54818 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GalcP54818 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GalcP54818 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GalcP54818 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GalcP54818 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GalcP54818 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GalcP54818 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GalcP54818 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GalcP54818 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GalcP54818 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GalcP54818 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GalcP54818 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GalcP54818 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GalcP54818 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GalcP54818 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GalcP54818 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GalcP54818 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GalcP54818 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GalcP54818 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GalcP54818 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GalcP54818 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GalcP54818 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GalcP54818 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GalcP54818 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GalcP54818 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GalcP54818 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GalcP54818 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GalcP54818 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GalcP54818 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GalcP54818 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms