Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-1P50220 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-1P50220 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms