Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg3P47867 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg3P47867 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg3P47867 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg3P47867 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg3P47867 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg3P47867 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg3P47867 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg3P47867 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg3P47867 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg3P47867 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg3P47867 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg3P47867 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms