Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TesP47226 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TesP47226 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TesP47226 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TesP47226 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TesP47226 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TesP47226 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TesP47226 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TesP47226 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TesP47226 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TesP47226 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TesP47226 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TesP47226 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TesP47226 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TesP47226 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TesP47226 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TesP47226 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TesP47226 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TesP47226 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TesP47226 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TesP47226 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TesP47226 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TesP47226 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TesP47226 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TesP47226 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TesP47226 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TesP47226 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TesP47226 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TesP47226 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TesP47226 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TesP47226 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TesP47226 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TesP47226 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TesP47226 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TesP47226 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TesP47226 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TesP47226 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TesP47226 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TesP47226 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TesP47226 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TesP47226 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TesP47226 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms