Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp2P46686 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tulp2P46686 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp2P46686 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms