Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx1P43345 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx1P43345 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms