Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgfrP43117 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtgfrP43117 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.4 ms