Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf6P43028 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf6P43028 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms