Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HttP42859 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HttP42859 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HttP42859 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HttP42859 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HttP42859 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HttP42859 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HttP42859 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HttP42859 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HttP42859 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HttP42859 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HttP42859 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HttP42859 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HttP42859 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HttP42859 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HttP42859 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HttP42859 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HttP42859 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HttP42859 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HttP42859 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HttP42859 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HttP42859 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HttP42859 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HttP42859 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HttP42859 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HttP42859 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HttP42859 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HttP42859 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HttP42859 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HttP42859 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HttP42859 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HttP42859 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HttP42859 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HttP42859 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HttP42859 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HttP42859 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HttP42859 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HttP42859 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HttP42859 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HttP42859 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HttP42859 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HttP42859 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HttP42859 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HttP42859 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HttP42859 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HttP42859 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HttP42859 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HttP42859 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HttP42859 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HttP42859 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HttP42859 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HttP42859 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HttP42859 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HttP42859 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395.8 ms