Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-2P42580 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nkx1-2P42580 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-2P42580 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms