Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept1P42209 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept1P42209 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sept1P42209 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept1P42209 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept1P42209 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sept1P42209 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept1P42209 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sept1P42209 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept1P42209 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms